バイオインフォマティックス Biopythonを使ってDNA配列をダウンロード 2021年2月27日 しばた https://edna-blog.com/wp-content/uploads/2020/03/img_6620-scaled.jpg はじめての環境DNA やりたいこと Entrezによるデータベース検索システムを使って配列情報を取得します。Entrezの検索システムは皆さんがNCBIで …
バイオインフォマティックス BiopythonによるNCBIからの情報取得 2021年1月24日 しばた https://edna-blog.com/wp-content/uploads/2020/03/img_6620-scaled.jpg はじめての環境DNA Entrezと呼ばれるNCBIのデータベースからデータを取得するシステムをBiopythonを使って利用します。 やりたいこと …
便利ツール 仕事・研究に使える環境DNAの関連情報をまとめてみた 2020年7月28日 しばた https://edna-blog.com/wp-content/uploads/2020/03/img_6620-scaled.jpg はじめての環境DNA ぜひ、研究や仕事でなどでお使いください。@しばた 目次 資料を作るとき論文を読む・調べるときプライマーを作るときDNA配列を収 …
便利ツール “環境DNA分析技術を用いた淡水魚類調査手法の手引き” について 2020年6月30日 しばた https://edna-blog.com/wp-content/uploads/2020/03/img_6620-scaled.jpg はじめての環境DNA 環境省生物多様性センターより淡水魚を対象とした環境DNA分析を利用する際の注意点などをまとめた調査手法の手引きが発表されました。 環 …
便利ツール 日本産魚類学名和名対応リスト 2020年5月16日 しばた https://edna-blog.com/wp-content/uploads/2020/03/img_6620-scaled.jpg はじめての環境DNA 鹿児島大学総合研究博物館の本村浩之さんが日本産魚類全種リストの標準和名と学名をまとめたものを発表してくださいました。 本村浩之．2020．日本産魚類全種目録．これまでに記録 …
便利ツール あったらいいなと思うものを。 Part.2 2020年4月22日 しばた https://edna-blog.com/wp-content/uploads/2020/03/img_6620-scaled.jpg はじめての環境DNA あったらいいなと思うもの第2弾は、より現場の意見を取り入れた環境DNAの解説ページです。ここも目指してますが、たくさんあるに越したことはないので紹介しておきます。@しばた …
便利ツール あったらいいなと思うものを。 2020年4月22日 しばた https://edna-blog.com/wp-content/uploads/2020/03/img_6620-scaled.jpg はじめての環境DNA タイトルの通り、あったらいいなと思うものを投稿していきます。@しばた データの処理過程やプライマーの作成過程で、作ったものや調べたことを便利ツールとしてまとめていきます。 …
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