環境DNA分析 頭足類の環境DNA分析のための核18SrRNA領域を対象とした新しいメタバーコーディングプライマー 2021年6月5日 しばた https://edna-blog.com/wp-content/uploads/2020/03/img_6620-scaled.jpg はじめての環境DNA A novel metabarcoding primer pair for environmental DNA analysis …
データの解析方法 メタバーコーディングのサポート機能として開発されたmitohelperの使用感について 2021年2月23日 しばた https://edna-blog.com/wp-content/uploads/2020/03/img_6620-scaled.jpg はじめての環境DNA Mitohelper：魚類の環境DNA研究のためのミトコンドリア参照配列分析ツール この記事でやりたい事と目的 Mit …
データの解析方法 新しいMiFishパイプライン PMiFish v2.4 2020年12月31日 しばた https://edna-blog.com/wp-content/uploads/2020/03/img_6620-scaled.jpg はじめての環境DNA PMiFish pipiline v2.4.1 Miya et al. 2020で使用されたASV法を採用した新しいMiFishパイ …
環境DNA分析 MiFishプライマーに関するレビュー論文 Part4 2020年12月31日 しばた https://edna-blog.com/wp-content/uploads/2020/03/img_6620-scaled.jpg はじめての環境DNA 魚類の環境DNAをメタバーコーディングするためのユニバーサルプライマー(MiFish : マイフィッシュ)の開発者本人によるレビュー論文の …
環境DNA分析 MiFishプライマーに関するレビュー論文 Part3 2020年12月20日 しばた https://edna-blog.com/wp-content/uploads/2020/03/img_6620-scaled.jpg はじめての環境DNA 魚類の環境DNAをメタバーコーディングするためのユニバーサルプライマー(MiFish : マイフィッシュ)の開発者本人によるレビュー論文の …
環境DNA分析 MiFishプライマーに関するレビュー論文 Part2 2020年10月14日 しばた https://edna-blog.com/wp-content/uploads/2020/03/img_6620-scaled.jpg はじめての環境DNA 魚類の環境DNAをメタバーコーディングするためのユニバーサルプライマー(MiFish : マイフィッシュ)の開発者本人によるレビュー論文の …
環境DNA分析 MiFishプライマーに関するレビュー論文 Part1 2020年10月14日 しばた https://edna-blog.com/wp-content/uploads/2020/03/img_6620-scaled.jpg はじめての環境DNA 魚類の環境DNAをメタバーコーディングするためのユニバーサルプライマー(MiFish : マイフィッシュ)の開発者本人によるレビュー論文で …
環境DNA使った調査・実験 メタバーコーディングプライマー 2020年9月9日 しばた https://edna-blog.com/wp-content/uploads/2020/03/img_6620-scaled.jpg はじめての環境DNA 環境DNAで使われているメタバーコーディングプライマーを中心にまとめました。基本的にMi ~と名の付くプライマーはMiseqの150PEで解読できるようになっているそうです。 …
環境DNA使った調査・実験 環境DNAの技術を使って特定種の同定にチャレンジ その1？ 2020年7月21日 しばた https://edna-blog.com/wp-content/uploads/2020/03/img_6620-scaled.jpg はじめての環境DNA ちょうど面白い検討も兼ねて、Miseqをランする機会でもあったので、お題の通り環境DNAの技術を流用して種の同定にチャレンジしました。@し …
データの解析方法 環境DNAによる定量的な遺伝的多様性の評価 2020年6月8日 しばた https://edna-blog.com/wp-content/uploads/2020/03/img_6620-scaled.jpg はじめての環境DNA 大学の時に調査した内容が論文になったので、宣伝もかねてまとめていきます。今までの系統地理研究や遺伝的多様性の調査に役立つようにと頑張りました。 目次 遺伝的多様性と …
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