環境DNA分析 MiFishプライマーに関するレビュー論文 Part1 2020年10月14日 しばた https://edna-blog.com/wp-content/uploads/2020/03/img_6620-scaled.jpg はじめての環境DNA 魚類の環境DNAをメタバーコーディングするためのユニバーサルプライマー(MiFish : マイフィッシュ)の開発者本人によるレビュー論文で …
マニア向け技術情報 環境DNAサンプルの阻害除去について 2020年10月1日 しばた https://edna-blog.com/wp-content/uploads/2020/03/img_6620-scaled.jpg はじめての環境DNA 最近忙しくブログの更新ができていませんでした。 ただ忙しい分検討は色々進めていて、ネタだけは貯まっています。 小さなネタはというか呟きはtwitterの方で発信してま …
環境DNA使った調査・実験 メタバーコーディングプライマー 2020年9月9日 しばた https://edna-blog.com/wp-content/uploads/2020/03/img_6620-scaled.jpg はじめての環境DNA 環境DNAで使われているメタバーコーディングプライマーを中心にまとめました。基本的にMi ~と名の付くプライマーはMiseqの150PEで解読できるようになっているそうです。 …
便利ツール 仕事・研究に使える環境DNAの関連情報をまとめてみた 2020年7月28日 しばた https://edna-blog.com/wp-content/uploads/2020/03/img_6620-scaled.jpg はじめての環境DNA ぜひ、研究や仕事でなどでお使いください。@しばた 目次 資料を作るとき論文を読む・調べるときプライマーを作るときDNA配列を収 …
環境DNA使った調査・実験 環境DNAの技術を使って特定種の同定にチャレンジ その1？ 2020年7月21日 しばた https://edna-blog.com/wp-content/uploads/2020/03/img_6620-scaled.jpg はじめての環境DNA ちょうど面白い検討も兼ねて、Miseqをランする機会でもあったので、お題の通り環境DNAの技術を流用して種の同定にチャレンジしました。@し …
論文 環境DNA論文 2020年6月 2020年7月18日 しばた https://edna-blog.com/wp-content/uploads/2020/03/img_6620-scaled.jpg はじめての環境DNA 今年の梅雨は長引きそうですね。雨の中の調査に出られる方はくれぐれもお気を付けください。@しばた 環境DNA論文 2020年7月 中旬現在 5月の論文まとめに引き続き、 …
便利ツール “環境DNA分析技術を用いた淡水魚類調査手法の手引き” について 2020年6月30日 しばた https://edna-blog.com/wp-content/uploads/2020/03/img_6620-scaled.jpg はじめての環境DNA 環境省生物多様性センターより淡水魚を対象とした環境DNA分析を利用する際の注意点などをまとめた調査手法の手引きが発表されました。 環 …
環境DNAの注意点 カリフォルニア海域用 MiFishデータベースの構築 2020年6月18日 しばた https://edna-blog.com/wp-content/uploads/2020/03/img_6620-scaled.jpg はじめての環境DNA さくっと紹介します。@しばた FishCARD: 効果的なメタバーコーディングのためのカリフォルニア海流域に特異的な魚類の12sのデ …
論文 環境DNA論文 2020年5月 2020年6月10日 しばた https://edna-blog.com/wp-content/uploads/2020/03/img_6620-scaled.jpg はじめての環境DNA 本格的に暑くなってきました。そしてすぐに梅雨入りしそうな予報です。緊急事態宣言も解除され、調査に出かけられる方も多いと思いますが、熱中症と急な増水などにはくれぐれもお気を付けくだ …
データの解析方法 環境DNAによる定量的な遺伝的多様性の評価 2020年6月8日 しばた https://edna-blog.com/wp-content/uploads/2020/03/img_6620-scaled.jpg はじめての環境DNA 大学の時に調査した内容が論文になったので、宣伝もかねてまとめていきます。今までの系統地理研究や遺伝的多様性の調査に役立つようにと頑張りました。 目次 遺伝的多様性と …
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