データの解析方法 新しいMiFishパイプライン PMiFish v2.4 2020年12月31日 しばた https://edna-blog.com/wp-content/uploads/2020/03/img_6620-scaled.jpg はじめての環境DNA PMiFish pipiline v2.4.1 Miya et al. 2020で使用されたASV法を採用した新しいMiFishパイ …
環境DNA分析 MiFishプライマーに関するレビュー論文 Part4 2020年12月31日 しばた https://edna-blog.com/wp-content/uploads/2020/03/img_6620-scaled.jpg はじめての環境DNA 魚類の環境DNAをメタバーコーディングするためのユニバーサルプライマー(MiFish : マイフィッシュ)の開発者本人によるレビュー論文の …
環境DNA分析 MiFishプライマーに関するレビュー論文 Part3 2020年12月20日 しばた https://edna-blog.com/wp-content/uploads/2020/03/img_6620-scaled.jpg はじめての環境DNA 魚類の環境DNAをメタバーコーディングするためのユニバーサルプライマー(MiFish : マイフィッシュ)の開発者本人によるレビュー論文の …
環境DNA分析 MiFishプライマーに関するレビュー論文 Part2 2020年10月14日 しばた https://edna-blog.com/wp-content/uploads/2020/03/img_6620-scaled.jpg はじめての環境DNA 魚類の環境DNAをメタバーコーディングするためのユニバーサルプライマー(MiFish : マイフィッシュ)の開発者本人によるレビュー論文の …
環境DNA分析 MiFishプライマーに関するレビュー論文 Part1 2020年10月14日 しばた https://edna-blog.com/wp-content/uploads/2020/03/img_6620-scaled.jpg はじめての環境DNA 魚類の環境DNAをメタバーコーディングするためのユニバーサルプライマー(MiFish : マイフィッシュ)の開発者本人によるレビュー論文で …
マニア向け技術情報 環境DNAサンプルの阻害除去について 2020年10月1日 しばた https://edna-blog.com/wp-content/uploads/2020/03/img_6620-scaled.jpg はじめての環境DNA 最近忙しくブログの更新ができていませんでした。 ただ忙しい分検討は色々進めていて、ネタだけは貯まっています。 小さなネタはというか呟きはtwitterの方で発信してま …
環境DNA使った調査・実験 メタバーコーディングプライマー 2020年9月9日 しばた https://edna-blog.com/wp-content/uploads/2020/03/img_6620-scaled.jpg はじめての環境DNA 環境DNAで使われているメタバーコーディングプライマーを中心にまとめました。基本的にMi ~と名の付くプライマーはMiseqの150PEで解読できるようになっているそうです。 …
便利ツール 仕事・研究に使える環境DNAの関連情報をまとめてみた 2020年7月28日 しばた https://edna-blog.com/wp-content/uploads/2020/03/img_6620-scaled.jpg はじめての環境DNA ぜひ、研究や仕事でなどでお使いください。@しばた 目次 資料を作るとき論文を読む・調べるときプライマーを作るときDNA配列を収 …
環境DNA使った調査・実験 環境DNAの技術を使って特定種の同定にチャレンジ その1？ 2020年7月21日 しばた https://edna-blog.com/wp-content/uploads/2020/03/img_6620-scaled.jpg はじめての環境DNA ちょうど面白い検討も兼ねて、Miseqをランする機会でもあったので、お題の通り環境DNAの技術を流用して種の同定にチャレンジしました。@し …
論文 環境DNA論文 2020年6月 2020年7月18日 しばた https://edna-blog.com/wp-content/uploads/2020/03/img_6620-scaled.jpg はじめての環境DNA 今年の梅雨は長引きそうですね。雨の中の調査に出られる方はくれぐれもお気を付けください。@しばた 環境DNA論文 2020年7月 中旬現在 5月の論文まとめに引き続き、 …
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